মুক্তিযুদ্ধ জাদুঘরের কর্মকাণ্ডের বড় লক্ষ্য দেশের নতুন প্রজন্মের কাছে ইতিহাসের বাস্তবতা ও সত্য মেলে ধরা। এ লক্ষ্যে ২০০৪ সাল থেকে জাদুঘর এক বিশেষ প্রকল্প গ্রহণ করেছে। ঢাকা মহানগরের যেসব শিক্ষাপ্রতিষ্ঠানের ছাত্রছাত্রীদের সংগঠিতভাবে নিয়ে আসা হয় জাদুঘর পরিদর্শনে অথবা খুদে জাদুঘর হিসেবে সজ্জিত জাদুঘরের যে বাস পৌঁছে যায় দূর-দূরান্তের শিক্ষাপ্রতিষ্ঠানে, সেখানে সবাই প্রত্যক্ষ করে প্রদর্শনী, পরিচিত হয় দেশের ইতিহাসের গৌরবময় পর্বের সঙ্গে।